Chùa thờ Phật và ba vị Trúc Lâm tam tổ là Phật Hoàng Trần Nhân Tông, thiền sư Pháp Loa và thiền sư Huyền Quang. Chùa Vĩnh Nghiêm được coi là chốn tổ của thiền phái Trúc Lâm, trường đại học Phật giáo đầu tiên ở Việt Nam.

Hiện nay, trong chùa còn lưu giữ được kho mộc bản vô giá mang nhiều nội dung từ kinh phật, sách văn học, nghiên cứu, tấu sớ, văn bia, lịch sử, danh nhân... với 3.050 bản ván khắc chữ Hán được làm từ gỗ thị.

Năm 1964, chùa Vĩnh Nghiêm được Nhà nước xếp hạng là di tích lịch sử - văn hóa cấp quốc gia. Năm 2012, Mộc bản chùa Vĩnh Nghiêm được UNESCO công nhận là Di sản Ký ức thế giới khu vực Châu Á, Thái Bình Dương.

Năm 2014, lễ hội chùa Vĩnh Nghiêm được Nhà nước công nhận đón nhận là di sản văn hóa phi vật thể quốc gia.

Lễ hội chùa Vĩnh Nghiêm được tổ chức vào ngày 14 tháng 2 âm lịch hằng năm. Đó cũng là ngày giỗ tổ chùa.

Năm nay, cùng với sự kiện này, huyện Yên Dũng cũng tổ chức lễ đón nhận Bằng Di sản văn hóa phi vật thể cho lễ hội chùa Vĩnh Nghiêm với nhiều hoạt động ý nghĩa.