Hai năm trở lại đây, sông Nhuệ chảy qua tỉnh Hà Nam bị ô nhiễm nghiêm trọng. Nồng độ chất Amoniac trong nước sông Nhuệ vượt khoảng 250 lần tiêu chuẩn cho phép; nồng độ COD vượt 3 đến 4 lần giới hạn cho phép. Điều đáng lo ngại là, nước sông Nhuệ thường xuyên bị ô nhiễm cấp 3; các loại tôm, cá khu vực hạ nguồn sông Nhuệ chết nổi trắng mặt sông vì ô nhiễm nước thải.